Grunnleggande bioinformatikk

Studenten skal ved avslutta emne ha følgjande læringsutbyte definert i kunnskapar, ferdigheiter og generell kompetanse:

Kunnskapar

Studenten skal:

• ha ei generell forståing av sentrale tema og konsept innan bioinformatikk
• ha ei grunnleggjande forståing av kva eit genom er og korleis ein "genome browser" kan brukast for å representere og utforske genom data
• kjenne til ulike typar av og døme på biologiske databasar og kunnskapsbasar
• kan forklare teorien som ligg bak vanlege metodar for sekvenssøk og sekvens-samanstilling
• kunne forklare og gjere bruk av dynamisk programmering for parvis samanstilling av korte sekvensar
• vere i stand til å samanlikne tekniske aspekt ved algoritmar for parvis lokal og global samanstilling
• forstå og vere i strand til å forklara grunnleggande molekylærbiologi og evolusjon relevant for sekvens-samanstilling og relatera dei med dei respektive algoritmane
• forstå og forklare dei viktigaste trinna for parvis og multippel sekvenssamanstilling
• kjenne algoritmane som ligg bak sekvenssøk, spesielt BLAST
• kjenne og anvende statistiske metodar for å bestemme sekvensomologi
• vere i stand til å bruke og forstå ulike mål for klassifikasjonsytelse i samanheng med biologisk sekvens-analyse
• ha ei grunnleggande forståing for ulike anvendelsesområder for bioinformatikk og være klar over relaterte etiske aspekt

Ferdigheiter

Studenten kan

• bruke utvalt bioinformatiske databaser, "genome browsere" og verktøy på en kunnskapsbasert måte
• programmere grunnleggjande algoritmar innan bioinformatikk og bruke slike algoritmar til å analysere konkrete data

Generell kompetanse

Studenten

• beherskar å arbeide i grupper for å svare på biologiske spørsmål med bruk av datamaskin
• forstå prinsippa bak nye online verktøy til sekvensanalyse