English:

My current research interest is how to evolve adaptations. The major tool for this is the Genetic Algorithm. Currently I use it to evolve decisions, behaviour and life histories in fish.

My interest in decisions has been a long walk starting with life-history-based optimizations. Triggered by how organisms are able to perform decisions that (seemingly) simultaneously can incorporate state-, age-, density-, and environment-dependent trade-off, I started with Geir Huse to model adaptations through Artificial Neural Networks, Genetic Algorithms, and Individual-Based Modelling. Later, I have focused (with Sergey Budaev, Marc Mangel and other TE colleagues) even more on how the decision archtecture in fish works, and how this can be utilised in modelling.

 

 

Norsk:

Jarl Giskes forskning er fokusert på forståelse av atferd, livssyklus og romlig utbredelse av dyreplankton og fisk. Dynamikken i økosystemet er summen av alle hendelser hos alle individer i alle arter. Det enkelte individs atferd er nesten alltid påvirket av mange faktorer samtidig, så som risiko for å bli spist, mulighet til å finne mat, temperatur og årstid. Matematisk modellering kan derfor være et nødvendig redskap for å forstå begivenhetene. Evolusjonen har gjennom naturlig seleksjon formet livssyklusene og atferdene til akvatiske organismer, slik at de er tilpasset både naturforholdene og andre levende organismer. Selv om det enkelte individ ikke har innsikt i sitt eget liv, så har evolusjonen formet sanseapparet og atferdsresponsene slik at organismen reagerer "fornuftig" på miljøforholdene. For å forstå dynamikken i et økosystem er det derfor nødvendig å forstå hva som motiverer organismene til å ha den atferden de har. Giskes forskning har derfor konsentrert seg om å forstå hva som motiverer individene til å handle. Giske har også (sammen med Per Jakobsen) skrevet en lærebok på norsk om evolusjon og økologi.

 

BIO 110 Evolusjon og økologi

VIT 210 Mennesket: natur og kultur

Vitenskapelig artikkel

• Giske, Jarl; Dumitru, Magda L.; Enberg, Katja et al. (2025). Premises for digital twins reporting on Atlantic salmon wellbeing. (ekstern lenke)
• Weidner, Jacqueline; Jensen, Camilla Håkonsrud; Giske, Jarl et al. (2024). Hormonal regulation of the phenotype into environmentally appropriate pace-of-life syndromes. (ekstern lenke)
• Budaev, Sergei; Dumitru, Magda L.; Enberg, Katja et al. (2024). Premises for a digital twin of the Atlantic salmon in its world: Agency, robustness, subjectivity and prediction. (ekstern lenke)
• Wilson, James A.; Giske, Jarl (2023). Does fishing dismantle fish culture and ecosystem structure? Questions about the implications of social learning among fish and fishers. (ekstern lenke)
• Jensen, Camilla Håkonsrud; Weidner, Jacqueline; Giske, Jarl et al. (2023). Adaptive host responses to infection can resemble parasitic manipulation. (ekstern lenke)
• Grimm, Volker; Railsback, Steven F.; Vincenot, Christian E. et al. (2020). The ODD protocol for describing agent-based and other simulation models: A second update to improve clarity, replication, and structural realism. (ekstern lenke)
• Weidner, Jacqueline; Jensen, Camilla Håkonsrud; Giske, Jarl et al. (2020). Hormones as adaptive control systems in juvenile fish. (ekstern lenke)
• Jensen, Camilla Håkonsrud; Weidner, Jacqueline; Giske, Jarl et al. (2020). Hormonal adjustments to future expectations impact growth and survival in juvenile fish. (ekstern lenke)
• Budaev, Sergei; Jørgensen, Christian; Mangel, Marc et al. (2019). Decision-making from the animal perspective: Bridging ecology and subjective cognition. (ekstern lenke)
• Budaev, Sergei; Giske, Jarl; Eliassen, Sigrunn (2018). AHA: A general cognitive architecture for Darwinian agents. (ekstern lenke)
• Folkvord, Arild; Gundersen, Geir; Albretsen, Jon et al. (2016). Impact of hatch date on early life growth and survival of Mueller’s pearlside (Maurolicus muelleri) larvae and life-history consequences. (ekstern lenke)
• Folkvord, Arild; Gundersen, Geir; Albretsen, Jon et al. (2016). Impact of hatch-date on early life growth and survival of Mueller's pearlside (Maurolicus Muelleri) larvae and life-history consequences. (ekstern lenke)
• Andersen, Bjørn Snorre; Jørgensen, Christian; Eliassen, Sigrunn et al. (2016). The proximate architecture for decision-making in fish. (ekstern lenke)
• Ni, Yuanming; Eskeland, Gunnar; Giske, Jarl et al. (2016). The global potential for carbon capture and storage from forestry. (ekstern lenke)
• Eliassen, Sigrunn; Andersen, Bjørn Snorre; Jørgensen, Christian et al. (2016). From sensing to emergent adaptations: Modelling the proximate architecture for decision-making. (ekstern lenke)
• Thingstad, T. Frede; Pree, Bernadette; Giske, Jarl et al. (2015). What difference does it make if viruses are strain-, rather than speciesspecific?. (ekstern lenke)
• Thingstad, Tron Frede; Våge, Selina; Storesund, Julia Endresen et al. (2014). A theoretical analysis of how strain-specific viruses can control microbial species diversity. (ekstern lenke)
• Godø, Olav Rune; Handegard, Nils Olav; Browman, Howard et al. (2014). Marine ecosystem acoustics (MEA): Quantifying processes in the sea at the spatio-temporal scales on which they occur. (ekstern lenke)
• Våge, Selina; Storesund, Julia Endresen; Giske, Jarl et al. (2014). Optimal defense strategies in an idealized microbial food web under trade-off between competition and defense. (ekstern lenke)
• Giske, Jarl; Eliassen, Sigrunn; Fiksen, Øyvind et al. (2014). The emotion system promotes diversity and evolvability. (ekstern lenke)
• Våge, Selina; Castellani, Marco; Giske, Jarl et al. (2013). Successful strategies in size structured mixotrophic food webs. (ekstern lenke)
• Giske, Jarl; Eliassen, Sigrunn; Fiksen, Øyvind et al. (2013). Effects of the emotion system on adaptive behavior. (ekstern lenke)
• Castellani, Marco; Våge, Selina; Strand, Espen et al. (2013). The Scaled Subspaces Method: A new trait-based approach to model communities of populations with largely inhomogeneous density. (ekstern lenke)
• Vincenzi, Simone; Crivelli, Alain J.; Giske, Jarl et al. (2012). Selective consequences of catastrophes for growth rates in a stream-dwelling salmonid. (ekstern lenke)
• Giske, Jarl; Jakobsen, Per Johan; Jørgensen, Christian (2012). Hva er et menneske? Hjernen mellom natur og kultur i et langt, historisk perspektiv. (ekstern lenke)
• Grimm, Volker; Berger, Uta; DeAngelis, Donald L. et al. (2010). The ODD protocol A review and first update. (ekstern lenke)
• Eliassen, Sigrunn; Jørgensen, Christian; Mangel, Marc et al. (2009). Quantifying the adaptive value of learning in foraging behavior. (ekstern lenke)
• Giske, Jarl (2008). Benefitting from bibliometry. (ekstern lenke)
• Eliassen, Sigrunn; Jørgensen, Christian; Mangel, Marc et al. (2007). Exploration or exploitation: life expectancy changes the value of learning in foraging strategies. (ekstern lenke)
• Eliassen, Sigrunn; Jørgensen, Christian; Giske, Jarl (2006). Co-existence of learners and stayers maintains the advantage of social foraging. (ekstern lenke)
• Grimm, Volker; Berger, Uta; Bastiansen, Finn et al. (2006). A standard protocol for describing individual-based and agent-based models. (ekstern lenke)
• Giske, Jarl; Mangel, Marc; Jakobsen, Per Johan et al. (2003). Explicit trade-off rules in proximate adaptive agents. (ekstern lenke)
• Fiksen, Øyvind; Aksnes, Dag Lorents; Flyum, Magni H. et al. (2002). The influence of turbidity on growth and survival of fish larvae: a numerical analysis. (ekstern lenke)
• Strand, Espen; Huse, Geir; Giske, Jarl (2002). Artificial evolution of life history and behavior. (ekstern lenke)
• Giske, Jarl; Huse, Geir; Berntsen, Jarle (2001). Spatial modelling for marine resource management, with a focus on fish. (ekstern lenke)
• Nøttestad, Leif; Giske, Jarl; Holst, Jens Chr. et al. (1999). A length-based hypothesis for feeding migrations in pelagic fish. (ekstern lenke)
• Huse, Geir; Strand, Espen; Giske, Jarl (1999). Implementing behaviour in individual-based models using neural networks and genetic algorithms. (ekstern lenke)
• Giske, Jarl; Huse, Geir; Fiksen, Øyvind (1998). Modelling spatial dynamics of fish. (ekstern lenke)
• Huse, Geir; Giske, Jarl (1998). Ecology in Mare Pentium; an individual-based spatio-temporal model for fish with adapted behaviour. (ekstern lenke)
• Eiane, Ketil; Aksnes, Dag Lorents; Giske, Jarl (1997). The significance of optical properties in competition among visual and tactile planktivores: a theoretical study. (ekstern lenke)
• Giske, Jarl; Salvanes, Anne Gro Vea (1995). Why Pelagic Planktivores should be Unselective Feeders. (ekstern lenke)
• Giske, Jarl; Aksnes, Dag Lorents; Balino, B.M. et al. (1990). Vertical distribution and trophic interactions of zooplankton and fish in Masfjorden, Norway. (ekstern lenke)

Vitenskapelig oversiktsartikkel/review

• Giske, Jarl; Budaev, Sergei; Eliassen, Sigrunn et al. (2025). Vertebrate decision making leads to the interdependence of behaviour and wellbeing. (ekstern lenke)
• Budaev, Sergei; Kristiansen, Tore S; Giske, Jarl et al. (2020). Computational animal welfare: Towards cognitive architecture models of animal sentience, emotion and wellbeing. (ekstern lenke)
• Stillman, Richard A.; Railsback, Steven F.; Giske, Jarl et al. (2015). Making predictions in a changing world: The benefits of individual-based ecology. (ekstern lenke)

Nettsider (opplysningsmateriale)

• Giske, Jarl (2020). Does the hormone system contain an ability to plan for the future?. (ekstern lenke)

Doktorgradsavhandling

• Weidner, Jacqueline; Eliassen, Sigrunn; Giske, Jarl et al. (2020). Modelling fish growth under hormonal regulation as a factor in Pace of Life. (ekstern lenke)
• Giske, Jarl (1990). Habitat profitability for pelagic animals : adaptive values along continuous vertical gradients. (ekstern lenke)

Populærvitenskapelig foredrag

• Foster, Craig; Henshilwood, Christopher; Giske, Jarl (2019). A 100 000 year aquatic journey with our southern African ancestors. (ekstern lenke)
• Giske, Jarl; Hansen, Jan Petter (2011). Biologi, Fysikk, Kunst og de Store Spørsmål. (ekstern lenke)

Intervju

• Taxt, Randi Elisabeth; Østgaard, Nikolai; Giske, Jarl et al. (2012). Rådyre tidsskrifter kveler økonomien til universiteter og høyskoler. (ekstern lenke)
• Utaker, Espen; Kvalbein, Jon; Henriksen, Jan-Olav et al. (2008). Skal skolen undervise skapelse?. (ekstern lenke)

Vitenskapelig Kapittel/Artikkel/Konferanseartikkel

• Bauer, Silke; Nolet, Bart A.; Giske, Jarl et al. (2011). Cues and decision rules in animal migration. (ekstern lenke)
• Huse, Geir; Giske, Jarl (2004). 33. Utilizing different levels of adaptation in individual-based modeling. (ekstern lenke)
• Huse, Geir; Giske, Jarl; Salvanes, Anne Gro Vea (2002). Individual based modelling. (ekstern lenke)
• Mangel, Marc; Fiksen, Øyvind; Giske, Jarl (2001). Chapter 4. Theoretical and statistical models in natural resource management and research. (ekstern lenke)
• Carlotti, Francois; Giske, Jarl; Werner, Francisco (2000). Modelling zooplankton dynamics. (ekstern lenke)
• Giske, Jarl; Salvanes, Anne Gro Vea (1999). Chapter 2. A model of enhancement potentials in open ecosystems. (ekstern lenke)
• Giske, Jarl (1998). Evolutionary models for fisheries management. (ekstern lenke)
• Giske, Jarl; Skjoldal, Hein Rune; Slagstad, Dag (1998). Ecological Modelling for Fisheries. (ekstern lenke)

Kronikk

• Giske, Jarl (2009). Darwins farlige ide. (ekstern lenke)
• Amundsen, Trond; Folstad, Ivar; Giske, Jarl et al. (2009). "Ida" er oversolgt. (ekstern lenke)
• Giske, Jarl (2003). Darwin på hjernen. (ekstern lenke)

Populærvitenskapelig artikkel

• Giske, Jarl (2009). Bli liv! Evolusjonens motor og begynnelse. (ekstern lenke)
• Giske, Jarl (2009). 150 år underveis mot den store syntesen. Vantro, tvil og tro på Darwin i ny sakprosa. (ekstern lenke)
• Giske, Jarl (2003). Replikatologi. (ekstern lenke)
• Giske, Jarl (2001). Millenium Man. (ekstern lenke)

Anmeldelse

• Giske, Jarl (2009). Gud + evolusjonen = sant + nyttig?. (ekstern lenke)
• Giske, Jarl (2009). Hoffnarrens tale: et ID-blikk på Darwinjubileet og evolusjonsteorien. (ekstern lenke)
• Giske, Jarl (2003). Lærer vi av Darwin-debatten?. (ekstern lenke)
• Giske, Jarl (2003). Susan Blackmore: Memesket. (ekstern lenke)

Dokumentar

• Giske, Jarl; Hansen, Jan Petter (2008). Hva skal vi med UiB. (ekstern lenke)

Lærebok

• Giske, Jarl; Jakobsen, Per Johan (2007). Evolusjon og økologi. En innføring. 2. utgave. (ekstern lenke)
• Giske, Jarl; Jakobsen, Per Johan (1999). Evolusjon og økologi - en innføring. (ekstern lenke)

Vitenskapelig foredrag

• Eliassen, Sigrunn; Jørgensen, Christian; Mangel, Marc et al. (2006). Coexistence of mobile and sedentary strategies maintains the advantage of social foraging. (ekstern lenke)
• Thingstad, T. Frede; Giske, Jarl; Rassoulzadegan, Fereidoun (2003). Predictable, chaotic or stochastic; do we understand the nature of the oceanic ecosystem?. (ekstern lenke)
• Giske, Jarl (2003). Evolusjon og økologi. (ekstern lenke)
• Eliassen, Sigrunn; Giske, Jarl; Mangel, Marc (2003). Hedonic models of fish behaviour. (ekstern lenke)
• Giske, Jarl (2002). Evolutionary approaches to behaviour in individual-based modelling. (ekstern lenke)
• Eliassen, Sigrunn; Torgersen, Thomas; Giske, Jarl (2002). Modellering av hedonisk atferd. (ekstern lenke)

Leksikonartikkel

• Thingstad, Tron Frede; Giske, Jarl (2003). Models and functioning of marine ecosystems. (ekstern lenke)

Poster

• Eliasen, Sigrun; Torgersen, Thomas; Giske, Jarl (2002). hedonisk atferdmodellering. (ekstern lenke)

Leserinnlegg

• Giske, Jarl; Jakobsen, Per (2000). Den evolverte hjernen. (ekstern lenke)
• Jakobsen, Per; Giske, Jarl (2000). Av natur er du kommet, til kultur er du blitt. (ekstern lenke)

Rapport

• Drange, Helge; Alendal, Guttorm; Thorkildsen, Finn et al. (1998). Geophysical/Economical Feasibility Study of Ocean Disposal of CO2 at Haltenbanken. (ekstern lenke)
• Stenevik, Erling Kåre; Giske, Jarl; Brattegard, T. et al. (1997). Biological impact of CO2 disposal in Norwegian waters: Preliminary review. (ekstern lenke)

Se en full oversikt over publikasjoner i Cristin

 

Updated publication list can be found here:

http://bio.uib.no/te/jg/publications.php

 

Artikler, leserbrev og kronikker på norsk finnes her:

http://bio.uib.no/te/jg/samfunnsdebatt.php