Automatisert avbildning
Enkeltbilder kan nå en størrelse på 32 000 x 32 000 piksler, og flere bilder kan tas opp med automatisk justering av fokus og andre parametere for elektronstrålen og detektorene. På denne måten kan høyoppløselige mosaikker av store områder genereres og effektivt screenes på kontoret for detaljer av interesse. Som et annet oversiktsalternativ kan bilder brukes til å definere flere interesseområder som deretter avbildes sekvensielt.
Automatisert avbildning kan brukes til alle typer material- og biovitenskapelige prøver, avbildningsmoduser og detektorer. De resulterende store datasettene er verdifulle ressurser og analyseres ofte ved hjelp av avanserte bildebehandlings- og funksjonsgjenkjenningsverktøy.