Cancer Genomics

Målet med kurset er å gi deltakerne teoretisk og praktisk kunnskap om genomskala-analyser av genforandringer i pasientprøver og i eksperimentelle modeller. Kurset vil fokusere på ulike metoder basert på "dyp-" eller "nestegenerasjonsekvensering", NGS, av RNA og DNA i svulster og normalprøver. Også analyser av kromatinets og kjernens struktur blir forelest, samt etiske og juridiske forhold og arvelig kreftpredisposisjon.

Anbefales som del av opplæringsdelen for ph.d.-kandidater knyttet til Forskerskolen til CCBIO.

Etter å ha fullført kurs, skal kandidatene ha:

Kunnskap om

• Hvilke typer mutasjoner som skjer under eller kan predisponere for kreftutvikling.
• Hvordan disse kan påvises med NGS-metoder og analyseres bioinformatisk.
• Hvordan mutasjonsanalyse kan brukes til stratifisering av pasienter både diagnostisk og terapeutisk.
• Ulike konsekvenser av gitte mutasjoner i ulike celletyper.
• Etiske og juridiske regler for genetiske analyser av pasientmateriale.

Ferdigheter

• Kunne formulere problemstillinger, velge metoder og planlegge for gjennomføring av NGS-analyser på pasientprøver.
• Kunne vurdere nytte og begrensinger ved bruk av NGS-metoder i diagnostikk og kreftforskning.
• Kjenne til hvilke kontaktpunkter som finnes for NGS i Bergen.
• Kunne formilde relevant litteratur og metoder for kreftgenomikk.

Generell kompetanse

• Kunne vurdere hvordan kunnskap om mutasjoner kan føre til økt kunnskap om tumorbiologiske mekanismer, bedre og mer presis diagnose og til målrettet behandling og oppfølging av kreftpasienter.