Jeg er leder for Institutt for informatikk og har i denne rollen overordnet ansvar for instituttets virksomhet inkludert forskning og utdanning.  

Mitt eget forskningsfelt er bioinformatikk - utvikling og bruk av informatikk-metoder på analyse av molekylærbiologiske data. Jeg er interessert i metoder for oppdaging av mønstre, data-analyse, algoritmer og maskinlæring anvendt på molekylærbiologiske data. Min forskning inkluderer tett samarbeid med eksperimentelle grupper innen for ulike biologiske og biomedisinske felt. Jeg arbeider med analyse av ulike typer data slik som DNA-sekvenser (og genomer), proteiners sekvenser og struktur, gen-uttrykkingsdata og data produsert av høykapasitets-teknologier innen for eksempel sekvensering. Gruppen min er også engasjert i utvikling og bruk av metoder for integrasjon av data og verktøy innen bioinformatikk.

Jeg underviser primært kurs innen feltet bioinformatikk, men har også undervist blant annet brukerkurs i informatikk og kurs innen databaser. 

2018

• Xiaokang Zhang; Marta Eide; Odd Andre Karlsen et al. (2018). Modelling the chemical defensome networks --- a dynamic visualisation of the involved genes and interactions in two fish species and human. (ekstern lenke)
• Marta Eide; Xiaokang Zhang; Odd Andre Karlsen et al. (2018). Modelling The Chemical Defensome Networks - A Comparative Dynamic Visualisation Of The Involved Genes And Interactions In Two Fish Species And Humans. (ekstern lenke)
• Xiaokang Zhang; Inge Jonassen (2018). EFSIS: Ensemble Feature Selection Integrating Stability. (ekstern lenke)
• Anders Goksøyr; Guttorm Alendal; Libe Aranguren Abadía et al. (2018). dCOD 1.0: DECODING THE SYSTEMS TOXICOLOGY OF ATLANTIC COD (GADUS MORHUA). (ekstern lenke)
• Xiaokang Zhang; Inge Jonassen (2018). EFSIS: Ensemble Feature Selection Integrating Stability. (ekstern lenke)

2009

• Frederic Pendino; Eric Nguyen; Inge Jonassen et al. (2009). Functional involvement of RINF, retinoid-inducible nuclear factor (CXXC5), in normal and tumoral human myelopoiesis. (ekstern lenke)

1998

• Alvis Brazma; Inge Jonassen; Jaak Vilo et al. (1998). Predicting Gene Regulatory Elements from their Expression Data in the Complete Yeast Genome (Extended Abstract). (ekstern lenke)
• Inge Jonassen (1998). Methods for discovering motifs from protein sequences and structures. (ekstern lenke)
• Alvis Brazma; Inge Jonassen; Jaak Vilo et al. (1998). Pattern discovery in biosequences. (ekstern lenke)

2011

• Monica Mannelqvist; Ingunn Marie Stefansson; Geir Bredholt et al. (2011). Gene Expression Patterns Related to Vascular Invasion and Aggressive Features in Endometrial Cancer. (ekstern lenke)

2020

• Essa Ahsan Khan; Xiaokang Zhang; Eileen Marie Hanna et al. (2020). Quantitative transcriptomics, and lipidomics in evaluating ovarian developmental effects in Atlantic cod (Gadus morhua) caged at a capped marine waste disposal site. (ekstern lenke)
• Trygve Brautaset; Inge Jonassen; Korbinian Bösl et al. (2020). På tide å sette av fem prosent av prosjektmidlene til datahåndtering?. (ekstern lenke)
• Yaxin Xue; Inge Jonassen; Lise Øvreås et al. (2020). Metagenome-assembled genome distribution and key functionality highlight importance of aerobic metabolism in Svalbard permafrost. (ekstern lenke)
• Katrine Lekang; Anders Lanzén; Inge Jonassen et al. (2020). Evaluation of a eukaryote phylogenetic microarray for environmental monitoring of marine sediments. (ekstern lenke)

2021

• Ksenia Lavrichenko; Øyvind Helgeland; Pål Rasmus Njølstad et al. (2021). SeeCiTe: a method to assess CNV calls from SNP arrays using trio data. (ekstern lenke)
• Morten Goodwin; Klas Henning Pettersen; Inge Jonassen (2021). Episode 2 - Inge Jonassen forklarer sammenheng mellom kunstig intelligens og proteinfolding. (ekstern lenke)

2010

• Finn Drabløs; Kjell Petersen; Jostein Johansen et al. (2010). The FUGE Bioinformatics platform: a central platform in the FUGE2 period. (ekstern lenke)
• Finn Drabløs; Kjell Petersen; Jostein Johansen et al. (2010). The FUGE Bioinformatics platform: a central platform in the FUGE2 period. (ekstern lenke)
• Steve Pettifer; Jon Ison; Matúš Kalaš et al. (2010). The EMBRACE web service collection. (ekstern lenke)

2013

• Susanne Balzer; Ketil Malde; Markus A. Grohme et al. (2013). Filtering duplicate reads from 454 pyrosequencing data. (ekstern lenke)

1997

• Alvis Brazma; Inge Jonassen; Ingvar Eidhammer et al. (1997). Relation patterns and their automatic discovery in biosequences. (ekstern lenke)
• Ingvar Eidhammer; David Gilbert; Inge Jonassen et al. (1997). A constraint based structure description language for biosequences. (ekstern lenke)

1995

• Inge Jonassen (1995). Discovering patterns conserved in sets of related protein sequences. (ekstern lenke)

1996

• Inge Jonassen (1996). Approaches to the automatic discovery of patterns in sequences. (ekstern lenke)

2012

• Stefan Johansson; Henrik Underthun Irgens; Kishankumar Chudasama et al. (2012). Exome sequencing and genetic testing for MODY. (ekstern lenke)
• Andrea Christoforou; Michael Dondrup; Morten Mattingsdal et al. (2012). Linkage-disequilibrium-based binning affects the interpretation of GWASs. (ekstern lenke)
• Anders Lanzén; Daniel H. Huson; M Gorfer et al. (2012). CREST--classification resources for environmental sequence tags. (ekstern lenke)

2024

• Dimitrios Kleftogiannis; Sonia Gavasso; Benedicte Sjo Tislevoll et al. (2024). Automated cell type annotation and exploration of single-cell signaling dynamics using mass cytometry. (ekstern lenke)

2022

• Dimitrios Kleftogiannis; Benedicte Sjo Tislevoll; Monica Hellesøy et al. (2022). Identifying predictors of survival in patients with leukemia using single-cell mass cytometry and machine learning. (ekstern lenke)

2006

• Anne Margrete Øyan; Trond Hellem Bø; Inge Jonassen et al. (2006). cDNA microarray analysis of non-selected cases of acute myeloid leukemia demonstrates distinct clustering independent of cytogenetic aberrations and consistent with morphological signs of differentiation. (ekstern lenke)

Se en fullstendig oversikt over publikasjoner i NVA.

Se også min profil i google scholar: https://scholar.google.com/citations?user=RqvFRN4AAAAJ&hl=no&oi=ao