Jeg er leder for Institutt for informatikk og har i denne rollen overordnet ansvar for instituttets virksomhet inkludert forskning og utdanning.  

Mitt eget forskningsfelt er bioinformatikk - utvikling og bruk av informatikk-metoder på analyse av molekylærbiologiske data. Jeg er interessert i metoder for oppdaging av mønstre, data-analyse, algoritmer og maskinlæring anvendt på molekylærbiologiske data. Min forskning inkluderer tett samarbeid med eksperimentelle grupper innen for ulike biologiske og biomedisinske felt. Jeg arbeider med analyse av ulike typer data slik som DNA-sekvenser (og genomer), proteiners sekvenser og struktur, gen-uttrykkingsdata og data produsert av høykapasitets-teknologier innen for eksempel sekvensering. Gruppen min er også engasjert i utvikling og bruk av metoder for integrasjon av data og verktøy innen bioinformatikk.

Jeg underviser primært kurs innen feltet bioinformatikk, men har også undervist blant annet brukerkurs i informatikk og kurs innen databaser. 

2018

• Marta Eide; Xiaokang Zhang; Odd Andre Karlsen et al. (2018). Modelling The Chemical Defensome Networks - A Comparative Dynamic Visualisation Of The Involved Genes And Interactions In Two Fish Species And Humans. (ekstern lenke)
• Xiaokang Zhang; Inge Jonassen (2018). EFSIS: Ensemble Feature Selection Integrating Stability. (ekstern lenke)
• Nello Blaser; Eileen Marie Hanna; Morten Brun et al. (2018). Discovering pathway perturbations with topological edge set enrichment analysis (TESEA). (ekstern lenke)

2013

• Susanne Balzer; Ketil Malde; Markus A. Grohme et al. (2013). Filtering duplicate reads from 454 pyrosequencing data. (ekstern lenke)
• Rasmus Skern-Mauritzen; Ketil Malde; Francois Besnier et al. (2013). How does sequence variability affect de novo assembly quality?. (ekstern lenke)
• Jon Ison; Matúš Kalaš; Inge Jonassen et al. (2013). EDAM: an ontology of bioinformatics operations, types of data and identifiers, topics and formats. (ekstern lenke)

1997

• Alvis Brazma; Inge Jonassen; Ingvar Eidhammer et al. (1997). Relation patterns and their automatic discovery in biosequences. (ekstern lenke)
• Ingvar Eidhammer; David Gilbert; Inge Jonassen et al. (1997). A constraint based structure description language for biosequences. (ekstern lenke)

2006

• Anne Margrete Øyan; Trond Hellem Bø; Inge Jonassen et al. (2006). cDNA microarray analysis of non-selected cases of acute myeloid leukemia demonstrates distinct clustering independent of cytogenetic aberrations and consistent with morphological signs of differentiation. (ekstern lenke)
• William R. Taylor; KA Lin; D Klose et al. (2006). Dynamic domain threading. (ekstern lenke)
• Helga Salvesen; Trond Hellem Bø; Ingunn Marie Stefansson et al. (2006). Gene expression profiles identify an aggressive phenotype in endometrial carcinoma. (ekstern lenke)

2008

• Gustavo De Souza; Hiwa Målen; Tina Søfteland et al. (2008). Validating divergent ORF annotation in M. tuberculosis datasets using LTQ-Orbitrap. (ekstern lenke)
• Ketil Malde; Inge Jonassen (2008). Repeats and EST analysis for new organisms. (ekstern lenke)
• Gustavo Antonio De Souza; Hiwa Målen; Tina Søfteland et al. (2008). High accuracy mass spectrometry analysis as a tool to verify and improve gene annotation using Mycobacterium tuberculosis as an example. (ekstern lenke)

2003

• Ole Johan Halvorsen; Anne Margrete Øyan; Trond Hellem Bø et al. (2003). Gene expression profiling in prostate cancer: cluster analysis and association with tumor differentation. (ekstern lenke)
• Karl-Henning Kalland; Anne Margrete Øyan; Lars A. Akslen et al. (2003). Global analysis of gene expression and regulatory patterns in cancer. (ekstern lenke)

2017

• Lina Wik Leiss; Ercan Mutlu; Anne Margrete Øyan et al. (2017). Tumour-associated glial host cells display a stem-like phenotype with a distinct gene expression profile and promote growth of GBM xenografts. (ekstern lenke)
• Anders Goksøyr; Malin Celander; Guttorm Alendal et al. (2017). dCod 1.0: decoding the systems toxicology of Atlantic cod (Gadus morhua). (ekstern lenke)

2004

• Trond Hellem Bø; Bjarte Dysvik; Inge Jonassen (2004). LSimpute: accurate estimation of missing values in microarray data with least squares methods. (ekstern lenke)

2000

• Jaak Vilo; Alvis Brazma; Inge Jonassen et al. (2000). Mining for putative regulatory elements in the yeast genome using gene expression data. (ekstern lenke)
• Inge Jonassen (2000). Protein structure comparison and motif discovery. (ekstern lenke)
• Inge Jonassen (2000). Protein Structure Motif Discovery. (ekstern lenke)

2019

• Yaxin Xue; Inge Jonassen; Lise Øvreås et al. (2019). Bacterial and archaeal metagenome-assembled genome sequences from Svalbard permafrost. (ekstern lenke)
• Marta Eide; Xiaokang Zhang; Odd Andre Karlsen et al. (2019). Chemical warfare in the aquatic environment - The chemical defensome networks of model fish species. (ekstern lenke)
• Xiaokang Zhang; Inge Jonassen (2019). An Ensemble Feature Selection Framework Integrating Stability. (ekstern lenke)

2014

• Ståle Nygård; Inge Jonassen (2014). The Norwegian Bioionformatics Platform. (ekstern lenke)

2015

• Geir Bredholt; Monica Mannelqvist; Ingunn Stefansson et al. (2015). Tumor necrosis is an important hallmark of aggressive endometrial cancer and associates with hypoxia, angiogenesis and inflammation responses. (ekstern lenke)
• Niklas Blomberg; Arlindo Oliveira; Barend Mons et al. (2015). The ELIXIR channel in F1000Research. (ekstern lenke)

1996

• Alvis Brazma; Inge Jonassen; Ingvar Eidhammer et al. (1996). Approaches to the automatic discovery of patterns in biosequences. (ekstern lenke)

1998

• Alvis Brazma; Inge Jonassen; Ingvar Eidhammer et al. (1998). Approaches to the automatic discovery of patterns in biosequences. (ekstern lenke)

Se en full oversikt over publikasjoner i Cristin

Se også min profil i google scholar: https://scholar.google.com/citations?user=RqvFRN4AAAAJ&hl=no&oi=ao